MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. JF98 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 9542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017254	ACT	2	6	1	6	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017254	TAA	3	9	29	37	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017254	ATT	3	9	43	51	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017254	T	6	6	50	55	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017254	T	7	7	57	63	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017254	T	7	7	65	71	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017254	AAAGA	2	10	85	94	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017254	T	8	8	103	110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017254	T	6	6	2104	2109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017254	T	6	6	2123	2128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017254	AAAATT	2	12	2139	2150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017254	ATA	2	6	2174	2179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017254	T	8	8	2230	2237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017254	T	6	6	2249	2254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017254	GA	3	6	2271	2276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017254	T	7	7	3119	3125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017254	T	7	7	3383	3389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017254	T	6	6	3397	3402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017254	A	6	6	3405	3410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017254	ATT	2	6	3414	3419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017254	ATT	2	6	3424	3429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017254	T	7	7	3446	3452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017254	AAT	3	9	4523	4531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017254	TAA	2	6	6082	6087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017254	TAG	2	6	6982	6987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017254	T	7	7	8399	8405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017254	AT	3	6	8417	8422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017254	AAT	2	6	8844	8849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017254	T	6	6	8863	8868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017254	A	6	6	8884	8889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017254	A	6	6	8904	8909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017254	T	7	7	11341	11347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017254	ATT	2	6	11358	11363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017254	ATT	2	6	11367	11372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017254	ATT	2	6	11375	11380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017254	A	7	7	11388	11394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017254	ATT	2	6	11405	11410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017254	ATT	2	6	11415	11420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017254	TAT	2	6	11421	11426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017254	CAAT	2	8	13942	13949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017254	A	7	7	13950	13956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017254	AT	4	8	13997	14004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017254	TA	3	6	14010	14015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017254	T	8	8	14017	14024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017254	T	6	6	14038	14043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017254	ATATA	2	10	14090	14099	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017254	T	6	6	14111	14116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017254	AAG	2	6	14122	14127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017254	A	7	7	14156	14162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017254	T	7	7	14198	14204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017254	T	6	6	14254	14259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017254	TAAA	2	8	14273	14280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017254	AAT	2	6	14303	14308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017254	TTA	2	6	14314	14319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017254	CAA	2	6	14344	14349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017254	A	6	6	14348	14353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017254	TTA	2	6	14651	14656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017254	A	6	6	14689	14694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017254	GA	3	6	14739	14744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017254	TACAA	2	10	14757	14766	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017254	A	9	9	14797	14805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017254	ATA	2	6	14820	14825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017254	AAT	2	6	14830	14835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017254	ATT	2	6	14862	14867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017254	ATA	3	9	14872	14880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017254	T	6	6	14881	14886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017254	TA	3	6	14891	14896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017254	AAT	2	6	14931	14936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017254	AGT	2	6	14951	14956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017254	ATTA	2	8	15007	15014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017254	T	7	7	15031	15037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017254	T	6	6	15046	15051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017254	TTTCT	2	10	15057	15066	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017254	GGCA	2	8	15072	15079	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017254	TAAA	2	8	15099	15106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017254	A	7	7	15104	15110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017254	A	6	6	15117	15122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017254	A	8	8	15151	15158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017254	ATG	2	6	15182	15187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017254	TTAGT	2	10	15191	15200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017254	TGG	2	6	15213	15218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017254	AGA	2	6	15225	15230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017254	TTTA	2	8	15304	15311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017254	TAG	2	6	15366	15371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017254	TAA	2	6	15387	15392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017254	T	7	7	15396	15402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017254	A	7	7	15471	15477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017254	ATG	2	6	15502	15507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017254	AAAG	2	8	15540	15547	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017254	TGAATA	2	12	15550	15561	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017254	ACAA	2	8	15578	15585	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017254	A	6	6	15597	15602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017254	GTG	2	6	15643	15648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017254	TGA	2	6	15662	15667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017254	TAA	2	6	15668	15673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017254	TAA	3	9	15704	15712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017254	TGGA	2	8	15737	15744	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017254	ACA	2	6	15755	15760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017254	AT	3	6	15807	15812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017254	TAAT	2	8	15862	15869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017254	AGAA	2	8	15928	15935	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017254	ATT	2	6	16004	16009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017254	ACTA	2	8	16016	16023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017254	TA	3	6	16027	16032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017254	TAT	2	6	16034	16039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017254	TAT	2	6	16059	16064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017254	TAT	2	6	16077	16082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017254	TGCG	2	8	16136	16143	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017254	AAC	2	6	16190	16195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017254	TA	3	6	16220	16225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017254	A	6	6	16225	16230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017254	A	6	6	16232	16237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017254	TAT	2	6	16297	16302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017254	T	6	6	16338	16343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017254	CCTG	2	8	16386	16393	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017254	T	6	6	16414	16419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017254	TCT	2	6	16432	16437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017254	A	7	7	16463	16469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017254	T	8	8	16504	16511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017254	TA	3	6	16540	16545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017254	TAT	2	6	16563	16568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017254	ACA	2	6	16569	16574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017254	TATCT	2	10	16581	16590	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017254	A	7	7	16598	16604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017254	AT	4	8	16628	16635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017254	ACC	2	6	18050	18055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017254	T	8	8	18104	18111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017254	ATC	2	6	18119	18124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017254	TGT	2	6	18135	18140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017254	T	6	6	18146	18151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017254	T	6	6	18161	18166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017254	ATATTT	2	12	18167	18178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017254	T	7	7	18184	18190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017254	A	7	7	18191	18197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017254	T	6	6	18202	18207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017254	TAAA	2	8	18234	18241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017254	A	6	6	18239	18244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017254	A	7	7	18246	18252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017254	TAA	2	6	18275	18280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017254	ATTAA	2	10	18311	18320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017254	A	6	6	18322	18327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017254	T	6	6	18331	18336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017254	AAT	2	6	18339	18344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017254	ATT	2	6	18353	18358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017254	TTTAT	2	10	20369	20378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017254	T	6	6	20384	20389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017254	T	6	6	20438	20443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017254	ATT	2	6	20463	20468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017254	AAAT	2	8	20478	20485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017254	TAA	2	6	20502	20507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017254	AAT	2	6	20516	20521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017254	AT	3	6	20544	20549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017254	A	9	9	20566	20574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_017254	TAT	2	6	20597	20602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017254	CAAT	2	8	20626	20633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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170	NC_017254	TACTT	2	10	20918	20927	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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172	NC_017254	AT	3	6	20956	20961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_017254	T	6	6	22871	22876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_017254	TAAT	2	8	40422	40429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_017254	T	6	6	40439	40444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_017254	TGATC	2	10	40463	40472	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
451	NC_017254	TAAA	2	8	40592	40599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_017254	TGA	2	6	40724	40729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
453	NC_017254	TTC	2	6	40761	40766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_017254	TCA	2	6	40775	40780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_017254	CCA	2	6	40865	40870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
456	NC_017254	GTT	2	6	40893	40898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
457	NC_017254	GCAT	2	8	40931	40938	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
458	NC_017254	CTA	2	6	40947	40952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
459	NC_017254	ACATAT	2	12	40968	40979	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
460	NC_017254	TTC	2	6	41016	41021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_017254	T	6	6	41132	41137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_017254	TTC	2	6	41161	41166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_017254	T	6	6	41253	41258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_017254	TGAT	2	8	41276	41283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
465	NC_017254	GCC	2	6	41303	41308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
466	NC_017254	ATC	2	6	41542	41547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
467	NC_017254	T	6	6	41559	41564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_017254	T	7	7	41580	41586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_017254	TTC	2	6	41593	41598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
470	NC_017254	ATG	2	6	41608	41613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
471	NC_017254	T	9	9	41638	41646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_017254	TGTTT	2	10	41702	41711	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
473	NC_017254	T	7	7	41733	41739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_017254	TAAA	2	8	41748	41755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_017254	TTC	2	6	41776	41781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
476	NC_017254	TTC	2	6	41801	41806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
477	NC_017254	T	7	7	41842	41848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_017254	GAA	2	6	41915	41920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
479	NC_017254	TAA	2	6	41959	41964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_017254	TCT	2	6	41969	41974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
481	NC_017254	CGC	2	6	42024	42029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
482	NC_017254	TCT	2	6	42119	42124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
483	NC_017254	TCT	2	6	42188	42193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
484	NC_017254	AAC	2	6	42196	42201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
485	NC_017254	TCCAT	2	10	42238	42247	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
486	NC_017254	T	6	6	42328	42333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_017254	T	6	6	42336	42341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_017254	TTA	2	6	42462	42467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_017254	AAC	2	6	42493	42498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
490	NC_017254	CTT	2	6	42503	42508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
491	NC_017254	CTG	2	6	42516	42521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
492	NC_017254	CTACTG	2	12	42534	42545	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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494	NC_017254	CAT	2	6	42639	42644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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497	NC_017254	AAT	2	6	42817	42822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_017254	CTT	2	6	42831	42836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
499	NC_017254	GATA	2	8	42845	42852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_017254	ACTA	2	8	42865	42872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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